和文総説(現在 – 2001年)はこちら

 

 

R. Ikeda, D. Noshiro, H. Morishita, S. Takada, S. Kagaeyama, Y. Fujioka, T. Funakoshi, S. Komatsu-Hirota, R. Arai, E. Ryzhii, M. Abe, T. Koga, M. Nakao, K. Sakimura, A. Horii, S. Waguri, Y. Ichimura, N. Noda, and M. Komatsu. Phosphorylation of phase-separated p62 bodies by ULK1 activates a redox-independent stress response. EMBO J. e113349, 2023.

 

K. Etoh and M. Nakao. A web-based integrative transcriptome analysis, RNAseqChef, uncovers cell/tissue type-dependent action of sulforaphane. J. Biol. Chem. 299: 104810, 2023.

 

M. Yamazaki, S. Hino, S. Usuki, Y. Miyazaki, T. Oda, M. Nakao, T. Ito, and K. Yamagata. YAP/BRD4-controlled ROR1 promotes tumor-initiating cells and hyperpoliferation in pancreatic cancer. EMBO J. e112614, 2023.

 

H. Araki, S. Hino, K. Anan, K. Kuribayashi, K. Etoh, D. Seko, R. Takase, K. Kohrogi, Y. Hino, Y. Ono, E. Araki, and M. Nakao. LSD1 defines the fiber type-selective responsiveness to environmental stress in skeletal muscle. eLife 12: e84618, 2023.

 

U. Thamrongwaranggoon, K. Kuribayashi, H. Araki, Y. Hino, T. Koga, W. Seubwai, S. Wongkham, M. Nakao, and S. Hino. Lactic acidosis induces metabolic and phenotypic reprogramming in cholangiocarcinoma cells via the upregulation of THBS1. Cancer Sci. 114: 1541–1555, 2023.

 

S. Hino, T. Sato, and M. Nakao. Chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) for detecting histone modifications and modifiers. Methods Mol. Biol. (In book: Epigenomics), Springer, 2577: 55-64, 2023.

 

Y. Hino, K. Nagaoka, S. Oki, K. Etoh, S. Hino, and M. Nakao. Mitochondrial stress induces AREG expression and epigenomic remodeling through c-JUN and YAP-mediated enhancer activation. Nucleic Acids Res. 50: 9765-9779, 2022.

 

U. Thamrongwaranggoon, M. Detarya, W. Seubwai, C. Saengboonee, S. Hino, T. Koga, M. Nakao, and S. Wongkham. Lactic acidosis promotes aggressive features of cholangiocarcinoma cells via upregulating ALDH1A3 expression through EGFR axis. Life Sci. 302: 120648, 2022.

 

Y. Hayashi, S. Kashio, K. Murotomi, S. Hino, W. Kang, K. Miyado, M. Nakao, M. Miura, S. Kobayashi, and M. Namihira. Biosynthesis of S-adenosyl-methionine enhances aging-related defects in Drosophila oogenesis. Sci. Rep. 12: 5593, 2022.

 

M. Kusakabe, E. Kakumu, F. Kurihara, K. Tsuchida, T. Maeda, H. Tada, K. Kusao, A. Kato, T. Yasuda, T. Matsuda, M. Nakao, M. Yokoi, W. Sakai, and K. Sugasawa. Histone deacetylation regulates nucleotide excision repair through an interaction with the XPC protein. iScience 25: 104040, 2022.

 

H. Matsumori, K. Watanabe, H. Tachiwana, T. Fujita, Y. Ito, M. Tokunaga, K. Sakata-Sogawa, H. Osakada, T. Haraguchi, A. Awatsu, H. Ochiai, Y. Sakata, K. Ochiai, T. Toki, E. Ito, I.G. Goldberg, K. Tokunaga, M. Nakao, and N. Saitoh. Ribosomal protein L5 facilitates rDNA bundling and nucleolar assembly. Life Sci. Alliance 5: e202101045, 2022.

 

T. Igata, H. Tanaka, K. Etoh, S. Hong, N. Tani, T. Koga, and M. Nakao. Loss of the transcription repressor ZHX3 induces senescence-associated gene expression and mitochondrial-nucleolar activation. PLoS One 17: e0262488, 2022.

 

Y. Kanki, M. Muramatsu, Y. Miyamura, K. Kikuchi, Y. Higashijima, R. Nakaki, JI. Suehiro, Y. Sasaki, Y. Kubota, H. Koseki, H. Morioka, T. Kodama, M. Nakao, D. Kurotaki, H. Aburatani, and T. Minami. Bivalent-histone-marked immediate-early gene regulation is vital for VEGF-responsive angiogenesis. Cell Rep. 38: 110332, 2022.

 

D. Kajioka, S. Hino, M. Nakao, K. Suzuki, and G. Yamada. Transcriptional competency for androgen-regulated sex-biased genes; the role of Sp1 in sexual development of external genitalia. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 118: e2024067118, 2021.

 

K. Kohrogi, S. Hino, A. Sakamoto, K. Anan, R. Takase, H. Araki, Y. Hino, K. Araki, T. Sato, K. Nakamura, and M. Nakao. LSD1 defines erythroleukemia metabolism by controlling lineage-specific transcription factors GATA1 and C/EBPα. Blood Adv. 5: 2305-2318, 2021.

 

H. Ohguchi, P. Park, T. Wang, B. Gryder, D. Ogiya, K. Kurata, X. Zhang, D. Li, C. Pei, T. Masuda, C. Johansson, V. Wimalasena, Y. Kim, S. Hino, S. Usuki, Y. Kawano, M. Samur, Y-T. Tai, N. Munshi, M. Matsuoka, S. Ohtsuki, M. Nakao, T. Minami, S. Lauberth, J. Khan, U. Oppermann, A. Durbin, K. Anderson, T. Hideshima, and J. Qi. Lysine demethylase 5A is required for MYC driven transcription in multiple myeloma. Blood Cancer Discov. 2: 370-387, 2021.

 

Y. Arima, Y. Nakagawa, T. Takeo, T. Ishida, T. Yamada, S. Hino, M. Nakao, S. Hanada, T. Umemoto, T. Suda, T. Sakuma, T. Yamamoto, T. Watanabe, K. Nagaoka, Y. Tanaka, Y.K. Kawamura, K. Tonami, H. Kurihara, Y. Sato, K. Yamagata, T. Nakamura, S. Araki, E. Yamamoto, Y. Izumiya, K. Sakamoto, K. Kaikita, K. Matsushita, K. Nishiyama, N. Nakagata, and K. Tsujita. Murine neonatal ketogenesis preserves mitochondrial energetics by preventing protein hyperacetylation. Nature Metab. 3: 196-210, 2021.

 

U. Tonsri, S. Wongkham, C. Wongkham, T. Koga, S. Hino, M. Nakao, S. Roytrakul, and W. Seubwai. High glucose-oxidative condition enhances proliferation and migration in cholangiocarcinoma cells via upregulation of alpha mannosidase MAN2A2 and chromatin factor CHD8. Cancer Sci. 112: 254-264, 2021.

 

Koga, F. Sasaki, K. Saeki, S. Tsuchiya, T. Okuno, M. Ohba, T. Ichiki, S. Iwamoto, H. Uzawa, K. Kitajima, C. Meno, E. Nakamura, N. Tada, Y. Fukui, J. Kikuta, M. Ishii, Y. Sugimoto, M. Nakao, and T. Yokomizo. Expression of leukotriene B4 receptor 1 defines functionally distinct DCs that control allergic skin inflammation. Cell. Mol. Immunol. 18: 1437-1449, 2021.

 

M. Nakao, H. Tanaka and T. Koga. Cellular senescence variation by metabolic and epigenomic remodeling. Trends Cell Biol. 30: 919-922, 2020.

 

T. Koga, F. Sasaki, K. Saeki, S. Tsuchiya, T. Okuno, M. Ohba, T. Ichiki, S. Iwamoto, H. Uzawa, K. Kitajima, C. Meno, E. Nakamura, N. Tada, Y. Fukui, J. Kikuta, M. Ishii, Y. Sugimoto, M. Nakao, T. Yokomizo. Expression of leukotriene B4 receptor 1 defines functionally distinct DCs that control allergic skin inflammation. Cell. Mol. Immunol. 18: 1437-1449, 2021.

 

H. Tanaka, T. Igata, K. Etoh, T. Koga, S. Takebayashi, and M. Nakao. The NSD2/WHSC1/MMSET methyltransferase protects cellular senescence-associated epigenomic remodeling. Aging Cell 19: e13173, 2020.

 

T. Yamamoto, A. Hirosue, M. Nakamoto, R. Yoshida, J. Sakata, Y. Matsuoka, K. Kawahara, Y. Nagao, M. Nagata, N. Takahashi, A. Hiraki, M. Shinohara, M. Nakao, N. Saitoh and H. Nakayama. BRD4 promotes metastatic potential in oral squamous cell carcinoma through the epigenetic regulation of the MMP2 gene. Br. J. Cancer 123: 580-590, 2020.

 

J. Tamaoki, M. Takeuchi, R. Abe, H. Kaneko, T. Wada, S. Hino, M. Nakao, Y. Furukawa, and M. Kobayashi. Splicing- and demethylase-independent functions of LSD1 in zebrafish primitive hematopoiesis. Sci. Rep. 10: 8521, 2020.

 

T. Horii, S. Morita, S. Hino, M. Kimura, Y. Hino, H. Kogo, M. Nakao, and I. Hatada. Successful generation of epigenetic disease model mice by targeted demethylation of the epigenome. Genome Biol. 21: 77, 2020.

 

Y. Yasuda, K. Tokunaga, T. Koga, C. Sakamoto, I.G. Goldberg, N. Saitoh, and M. Nakao. Computational analysis of morphological and molecular features in gastric cancer tissues. Cancer Med. 9: 2223-2234, 2020.

 

R. Fujita, T. Yamamoto, Y. Arimura, S. Fujiwara, H. Tachiwana, Y. Ichikawa, Y. Sakata, L. Yang, R. Maruyama, M. Hamada, M. Nakao, N. Saitoh, and H. Kurumizaka. Nucleosome destabilization by nuclear-RNAs. Commun. Biol. 3: 60, 2020.

 

N. Nishikura, K. Hino, T. Kimura, Y. Uchimura, S. Hino, M. Nakao, Y. Maruo, and J. Udagawa. Postweaning iron deficiency in male rats leads to long-term hyperactivity and decreased Reelin gene expression in the nucleus accumbens. J. Nutrition 150: 212-221, 2020.

 

T. Osawa, T. Shimamura, K. Saito, Y. Hasegawa, N. Ishii, M. Nishida, R. Ando, A. Kondo, M. Anwar, R. Tsuchida, S. Hino, A. Sakamoto, K. Igarashi, K. Saitoh, K. Kato, K. Endo, S. Yamano, Y. Kanki, Y. Matsumura, T. Minami, T. Tanaka, M. Anai, Y. Wada, H. Wanibuchi, M. Hayashi, A. Hamada, M. Yoshida, S. Yachida, M. Nakao, J. Sakai, H. Aburatani, M. Shibuya, K. Hanada, S. Miyano, T. Soga, and T. Kodama. Phosphoethanolamine Accumulation Protects Cancer Cells under Glutamine Starvation through Downregulation of PCYT2. Cell Rep. 29: 89-103, 2019.

 

M.O.A. Abdalla, T. Yamamoto, K. Maehara, J. Nogami, Y. Ohkawa, H. Miura, R. Poonperm, I. Hiratani, H. Nakayama, M. Nakao, and N. Saitoh. The Eleanor ncRNAs activate the topological domain of the ESR1 locus to balance against apoptosis. Nature Commun. 10: 3778, 2019.

 

K. Nishimura, Y. Cho, K. Tokunaga, M. Nakao, T. Tani, and T. Ideue. DEAH box RNA helicase DHX38 associates with satellite I noncoding RNA involved in chromosome segregation. Genes Cells 24: 585-590, 2019.

 

M. Nakao, K. Anan, H. Araki, and S. Hino. Distinct roles of NAD+-Sirt1 and FAD-LSD1 pathways in metabolic response and tissue development. Trends Endocrinol. Metab. 30: 409-412, 2019.

 

R. Takase, S. Hino, K. Nagaoka, K. Anan, K. Kohrogi, H. Araki, Y. Hino, A. Sakamoto, T. B. Nicholson, T. Chen and M. Nakao. Lysine-specific demethylase-2 is distinctively involved in brown and beige adipogenic differentiation. FASEB J. 33: 5300-5311, 2019.

 

A.R. Acebedo, K. Suzuki, S. Hino, M.C. Alcantara, H. Haga, K. Matsumoto, M. Nakao, K. Shimamura, T. Taeko, N. Nakagata, S. Miyagawa, R. Nishinakamura, R.S Adelstein, and G. Yamada. Mesenchymal actomyosin contractility is required for androgen-driven mouse urethral masculinization. Commun. Biol. 2: 95, 2019.

 

T. Yamamoto, C. Sakamoto, H. Tachiwana, M. Kumabe, T. Matsui, T. Yamashita, M. Shinagawa, K. Ochiai, N. Saitoh, and M. Nakao. Endocrine therapy-resistant breast cancer model cells are inhibited by soybean glyceollin I through Eleanor non-coding RNA. Sci. Rep. 8: 15202, 2018.

 

M. Nakao, S. Fujiwara, and H. Iwase. Cancer navigation strategy for endocrine therapy-resistant breast tumors. Trends Cancer 4: 404-407, 2018.

 

K. Anan, S. Hino, N. Shimizu, A. Sakamoto, K. Nagaoka, R. Takase, K. Kohrogi, H. Araki, Y. Hino, S. Usuki, S. Oki, H. Tanaka, K. Nakamura, F. Endo, and M. Nakao. LSD1 mediates metabolic reprogramming by glucocorticoids during myogenic differentiation. Nucleic Acids Res. 46: 5441-5454, 2018.

 

M. Takagi, T. Ono, T. Natsume, C. Sakamoto, M. Nakao, N. Saitoh, M.T. Kanemaki, T. Hirano, and N. Imamoto. Ki-67 and condensins support the integrity of mitotic chromosomes through distinct mechanisms. J. Cell Sci. 131: 1-13, 2018.

 

T. Kimura, K. Hino, T. Kono, A. Takano, N. Nitta, N. Ushio, S. Hino, R. Takase, M. Kudo, Y. Daigo, W. Morita, M. Nakao, M. Nakatsukasa, T. Tamagawa, and J. Udagawa. Maternal undernutrition during early pregnancy in rats inhibits postnatal growth of hindlimb bones in the offspring by alteration of chondrogenesis. Gen. Comp. Endocrinol. 260: 58-66, 2018.

 

Y. Kitano, Y. Baba, S. Nakagawa, K. Miyake, M. Iwatsuki, Y. Sakamoto, Y. Yamashita, N. Yoshida, M. Watanabe, M. Nakao, and H. Baba. Nrf2 promotes esophageal cancer cell proliferation via metabolic reprogramming and ROS detoxification. J. Pathol. 244: 346-357, 2018.

 

T. Ono, C. Sakamoto, M. Nakao, N. Saitoh, and T. Hirano. Condensin II plays an essential role in reversible assembly of mitotic chromosomes in situ. Mol. Biol. Cell 28: 2875-2886, 2017.

 

A. Tanaka, M.O. Radwan, A. Hamasaki, A. Ejima, E. Obata, R. Koga, H. Tateishi, Y. Okamoto, M. Fujita, M. Nakao, K. Umezawa, F. Tamanoi, and M. Otsuka. A novel inhibitor of farnesyltransferase with a zinc site recognition moiety and a farnesyl group. Bioorg. Med. Chem. 27: 3862-3866, 2017.

 

W.A. Hassan, S. Takebayashi, M.O.A. Abdalla, K. Fujino, S. Kudoh, Y. Motooka, Y. Sato, Y. Naito, K. Higaki, J. Wakimoto, S. Okada, M. Nakao, Y. Ishikawa, and T. Ito. Correlation between histone acetylation and expression of Notch1 gene in human lung carcinoma and its role in the origin of combined small cell lung carcinoma. Lab. Invest. 97: 913-921, 2017.

 

X. Wang, S. Liang, Y. Sun, H. Li, F. Endo, M. Nakao, N. Saitoh, and L. Wu. Analysis of estrogen receptor b gene methylation in autistic males in a Chinese Han population. Metab. Brain Dis. 32: 1033-1042, 2017.

 

H. Tanaka, S. Takebayashi, A. Sakamoto, T. Igata, Y. Nakatsu, N. Saitoh, S. Hino, and M. Nakao. The loss of SETD8/PR-Set7 methyltransferase induces cellular senescence via nucleolar-mitochondrial coactivation. Cell Rep. 18: 2148-2161, 2017.

 

M. Nakamoto, K. Ishihara, T. Watanabe, A. Hirosue, S. Hino, M. Shinohara, H. Nakayama, and M. Nakao. The glucocorticoid receptor regulates the ANGPTL4 gene in a CTCF-mediated chromatin context in human hepatic cells. PLoS One 12: e0169225, 2017

 

K. Ishihara, M. Nakamoto, and M. Nakao. DNA methylation-independent removable insulator controls chromatin remodeling at the HOXA gene locus via retinoic acid signaling. Hum. Mol. Genet. 25: 5383-5394, 2016.

 

Tsutsumi, K. Iwao, H. Hayashi, T. Kawaji, T. Inoue, S. Hino, M. Nakao, and H. Tanihara. Potential neuroprotective effects of an LSD1 inhibitor in retinal ganglion cells via p38 MAPKγ activity. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 57: 6461-6473, 2016.

 

S. Tomita, M.O. Abdalla, S. Fujiwara, T. Yamamoto, H. Iwase, M. Nakao, and N. Saitoh. Roles of long non-coding RNAs in chromosome domains. Wiley Interdiscip. Rev. RNA, (Reviews) 8: 2017 (doi: 10.1002/wrna.1384).

 

S. Hino, K. Kohrogi, and M. Nakao. Histone demethylase LSD1 controls the phenotypic plasticity of cancer cells. Cancer Sci. (Reviews) 107: 1187-1192, 2016.

 

P. Miyazato, H. Katsuya, A. Fukuda, Y. Uchiyama, M. Matsuo, M. Tokunaga, S. Hino, M. Nakao, and Y. Satou. Application of targeted enrichment to next-generation sequencing of retroviruses integrated into the host human genome. Sci. Rep. 6: 28324, 2016.

 

K. Nakamura, Y. Baba, K. Kosumi, K. Harada, H. Shigaki, K. Miyake, Y. Kiyozumi, M. Ohuchi, J. Kurashige, T. Ishimoto, M. Iwatsuki, Y. Sakamoto, N. Yoshida, M. Watanabe, M. Nakao, and H. Baba. UHRF1 regulates global DNA hypomethylation and is associated with poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma. Oncotarget 7: 57821-57831, 2016.

 

T. Nakayama, N. Saitoh, K. Morotomi-Yano, KI. Yano, M. Nakao, and H. Saitoh. Tunicamycin induces discharge of the nucleus and chromatin fibers to extracellular spaces in a range of myeloid cell lines. Cell Biol. Int. 40: 597-602, 2016.

 

Y. Satou, P. Miyazato, K. Ishihara, A. Fukuda, K. Nosaka, T. Watanabe, A. Rowan, M. Nakao, and C. R.M. Bangham. The human retrovirus HTLV-1 inserts an ectopic CTCF-binding site into the human genome. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 113: 3054-3059, 2016.

 

Y. Xi, W. Shen, L. Ma, M. Zhao, J. Zheng, S. Bu, S. Hino, and M. Nakao. HMGA2 promotes adipogenesis by activating C/EBPβ-mediated expression of PPARγ. Biochem. Biophys. Res. Commun. 472: 617-623, 2016.

 

A. Matsumoto, C. Sakamoto, H. Matsumori, J. Katahira, Y. Yasuda, K. Yoshidome, M. Tsujimoto, I.G. Goldberg, N. Matsuura, M. Nakao, N. Saitoh, and M. Hieda. Loss of the integral nuclear envelope protein SUN1 induces alteration of nucleoli. Nucleus 7: 68-83, 2016.

 

K. Kosumi, Y. Baba, T. Ishimoto, A. Sakamoto, K. Harada, J. Kurashige, Y. Hiyoshi, M. Iwatsuki, S. Iwagami, Y. Miyamoto, Y. Sakamoto, N. Yoshida, M. Watanabe, S. Hino, M. Nakao, and H. Baba. Lysine-specific demethylase-1 contributes to malignant behavior by regulation of invasive activity and metabolic shift in esophageal cancer. Int. J. Cancer 138: 428-439, 2016.

 

Y. Matsumura, R. Nakaki, T. Inagaki, A. Yoshida, Y. Kano, H. Kimura, T. Tanaka, S. Tsutsumi, M. Nakao, T. Doi, K. Fukami, T.F. Osborne, T. Kodama, H. Aburatani, and J. Sakai. H3K4/H3K9me3 bivalent chromatin domains targeted by lineage-specific DNA methylation pauses adipocyte differentiation. Mol. Cell 60: 584-596, 2015.

 

T. Koga, M.A. Suico, S. Shimasaki, E. Watanabe, Y. Kai, K. Koyama, K. Omachi, S. Morino-Koga, T. Sato, T. Shuto, K. Mori, S. Hino, M. Nakao, and H. Kai. Endoplasmic reticulum (ER) stress induces Sirtuin 1 (SIRT1) expression via PI3K-Akt-GSK3 signaling pathway and promotes hepatocellular injury. J. Biol. Chem. 290: 30366-30374, 2015.

 

TF. Ali, K. Iwamaru, HI. Ciftci, R. Koga, M. Matsumoto, Y. Oba, H. Kurosaki, M. Fujita, Y. Okamoto, K. Umezawa, M. Nakao, T. Hide, K. Makino, J. Kuratsu, M. Abdel-Aziz, Gel-D. Abuo-Rahma, EA. Beshr, and M. Otsuka. Novel metal chelating molecules with anticancer activity. Striking effect of the imidazole substitution of the histidine-pyridine-histidine system. Bioorg. Med. Chem. 23: 5476-5482, 2015.

 

H. Kitamura, H. Matsumori, A. Kalendova, P. Hozak, I.G. Goldberg, M. Nakao, N. Saitoh, and M. Harata. The actin family protein ARP6 contributes to the structure and the function of the nucleolus.Biochem. Biophys. Res. Commun. 464: 554-560, 2015.

 

K. Wagatsuma, S. Tani-ichi, B. Liang, S. Shitara, K. Ishihara, M. Abe, H. Miyachi, S. Kitano, T. Hara, M. Nanno, H. Ishikawa, K. Sakimura, M. Nakao, H. Kimura, and K. Ikuta. STAT5 orchestrates local epigenetic changes for chromatin accessibility and rearrangements by direct binding to the TCRg locus. J. Immunol. 195: 1804-1814, 2015.

 

A. Murata, Y. Baba, T. Ishimoto, K. Miyake, K. Kosumi, K. Harada, J. Kurashige, S. Iwagami, Y. Sakamoto, Y. Miyamoto, N. Yoshida, M. Yamamoto, S. Oda, M. Watanabe, M. Nakao, and H. Baba. TET family proteins and 5-hydroxymethylcytosine in esophageal squamous cell carcinoma. Oncotarget 6: 23372-23382, 2015.

 

S. Takebayashi, H. Tanaka, S. Hino, Y. Nakatsu, T. Igata, A. Sakamoto, M. Narita, and M. Nakao. Retinoblastoma protein promotes oxidative phosphorylation through up-regulation of glycolytic genes in oncogene-induced senescent cells. Aging Cell 14: 689-697, 2015.

 

S. Tomita, M.O. Abdalla, S. Fujiwara, H. Matsumori, K. Maehara, Y. Ohkawa, H. Iwase, N. Saitoh, and M. Nakao. A cluster of non-coding RNAs activates the ESR1 locus during breast cancer adaptation to hormone deprivation. Nature Commun. 6: 6966, 2015.

 

A. Sakamoto, S. Hino, K. Nagaoka, K. Anan, R. Takase, H. Matsumori, H. Ojima, Y. Kanai, K. Arita, and M. Nakao. Lysine demethylase LSD1 coordinates glycolytic and mitochondrial metabolism in hepatocellular carcinoma cells. Cancer Res. 75: 1445-1456, 2015.

 

K. Nagaoka, S. Hino, A. Sakamoto, K. Anan, R. Takase, T. Umehara, S. Yokoyama, Y. Sasaki, and M. Nakao. Lysine-specific demethylase LSD2 suppresses lipid influx and metabolism in hepatic cells.Mol. Cell. Biol. 35: 1068-1080, 2015.

 

K. Tokunaga, N. Saitoh, I.G. Goldberg, C. Sakamoto, Y. Yasuda, Y. Yoshida, S. Yamanaka, and M. Nakao. Computational image analysis of colony and nuclear morphology to evaluate human induced pluripotent stem cells. Sci. Rep. 4: 6996, 2014.

 

S. Kanda, T. Ohmori, A. Taguchi, K. Kudo, T. Horiuchi, Y. Sato, S. Hino, Y. Suzuki, M. Sander, S. Sugano, M. Nakao, and R. Nishinakamura. Sall1 co-operates with Six2 to actively maintain nephron progenitors. J. Am. Soc. Nephrol. 25: 2584-2595, 2014.

 

N. Sugeno, T. Hasegawa, N. Tanaka, M. Fukuda, K. Wakabayashi, R. Oshima, M. Konno, E. Miura, A. Kikuchi, T. Baba, T. Anan, M. Nakao, S. Geisler, M. Aoki, and A. Takeda. K63-linked ubiquitination by Nedd4-1 facilitates endosomal sequestration of internalized alpha-synuclein. J. Biol. Chem. 289: 18137-18151, 2014.

 

T. Baba, H. Otake, T. Sato, K. Miyabayashi, Y. Shishido, C-Y. Wang, Y. Shima, H. Kimura, M. Yagi, Y. Ishihara, S. Hino, H. Ogawa, M. Nakao, T. Yamazaki, D. Kang, Y. Ohkawa, M. Suyama, B-C. Chung, and K. Morohashi. Glycolytic genes as the targets of a nuclear receptor Ad4BP/SF-1. Nature Commun.5: 3634, 2014.

 

A. Murata, Y. Baba, M. Watanabe, H. Shigaki, K. Miyake, T. Ishimoto, M. Iwatsuki, S. Iwagami, N. Yoshida, E. Oki, M. Morita, M. Nakao, and H. Baba. IGF2 DMR0 methylation, loss of imprinting, and patient prognosis in esophageal squamous cell carcinoma. Ann. Surg. Oncol. 21: 1166-1174, 2014.

 

Y. Baba, M. Watanabe, A. Murata, H. Shigaki, K. Miyake, T. Ishimoto, M. Iwatsuki, S. Iwagami, N. Yoshida, E. Oki, K. Sakamaki, M. Nakao, and H. Baba. LINE-1 hypomethylation, DNA copy number alterations, and CDK6 amplification in esophageal squamous cell carcinoma. Clin. Cancer Res. 20: 1114-1124, 2014.

 

N. Sasai, N. Saitoh, H. Saitoh, and M. Nakao. The transcriptional cofactor MCAF1/ATF7IP is involved in histone gene expression and cellular senescence. Plos One 87: e68478, 2013.

 

S. Hino, K. Nagaoka, and M. Nakao. Metabolism-epigenome crosstalk in physiology and diseases. J. Hum. Genet. (Reviews, Special Section on Epigenomics: biological understanding and clinical application) 58: 410-415, 2013.

 

S. Hino, A. Sakamoto, K. Nagaoka, K. Anan, Y. Wang, S. Mimasu, T. Umehara, S. Yokoyama, K. Kosai, and M. Nakao. FAD-dependent lysine demethylase LSD1 regulates cellular energy expenditure.Nature Commun. 3: 758, 2012.

 

A. Hirosue, K. Ishihara, K. Tokunaga, T. Watanabe, N. Saitoh, T. Chandra, M. Narita, M. Shinohara, and M. Nakao. Quantitative assessment of higher-order chromatin structure of the INK4/ARF locus in human senescent cells. Aging Cell 11: 553-556, 2012.

 

T. Watanabe, K. Ishihara, A. Hirosue, S. Watanabe, S. Hino, H. Ojima, Y. Kanai, Y. Sasaki, and M. Nakao. Higher-order chromatin regulation and differential gene expression in human tumor necrosis factor/lymphotoxin locus in hepatocellular carcinoma cells. Mol. Cell. Biol. 32: 1529-1541, 2012.

 

M. Taura, M.A. Suico, K. Koyama, K. Komatsu, R. Miyakita, C. Matsumoto, E. Kudo, R. Kariya, H. Goto, S. Kitajima, C. Takahashi, T. Shuto, M. Nakao, S. Okada, and H. Kai. Rb/E2F1 regulate innate immune receptor Toll-like receptor 3 in epithelial cells. Mol. Cell. Biol. 32: 1581-1590, 2012.

 

A. Fournier, N. Sasai, M. Nakao and P.A. Defossez. The role of methyl-binding proteins in chromatin organization and epigenome maintenance. Brief Funct. Genomics 11: 251-264, 2012.

 

N. Saitoh, C. Sakamoto, M. Hagiwara, L.T. Agredano-Moreno, L.F. Jimenez-Garcia, and M. Nakao. The distribution of phosphorylated SR proteins and alternative splicing are regulated by RANBP2. Mol. Biol. Cell 23: 1115-1128, 2012.

 

Y. Xi, S. Watanabe, Y. Hino, C. Sakamoto, Y. Nakatsu, S. Okada, and M. Nakao. Hmga1 is differentially expressed and mediates silencing of the Cd4/Cd8 loci in T cell lineages and leukemic cells. Cancer Sci. 103: 439-447, 2012.

 

S. Nagashima, T. Fukuda, Y. Kubota, A. Sugiura, M. Nakao, R. Inatome, and S. Yanagi. CRAG protects neuronal cells against cytotoxicity of expanded polyglutamine protein partially via c-Fos-dependent AP-1 activation. J. Biol. Chem. 286: 33879-33889, 2011.

 

N. Sasai, M. Nakao, and P-A. Defossez. Sequence-specific recognition of methylated DNA by human zinc-finger proteins. Nucleic Acids Res. 38: 5015-5022, 2010.

 

L-K. Chang, J-Y. Chuang, M. Nakao, S-T. Liu. MCAF1 and Synergistic activation of the transcription of Epstein-Barr virus lytic genes by Rta and Zta. Nucleic Acids Res. 38: 4687-4700, 2010.

 

J. Uwada, N. Tanaka, Y. Yamaguchi, Y. Uchimura, K. Shibahara, M. Nakao, and H. Saitoh. The p150 subunit of CAF-1 causes association of SUMO2/3 with the DNA replication foci. Biochem. Biophys. Res. Commun. 391: 407-413, 2010.

 

S. Akaboshi, S. Watanabe, Y. Hino, Y. Sekita, K. Araki, K. Yamamura, M. Oshima, T. Ito, H. Baba, and M. Nakao. HMGA1 is induced by Wnt/β-catenin pathway and maintains cell proliferation in gastric cancer. Am. J. Pathol. 175: 1675-1685, 2009. 

 

S. Tei, N. Saitoh, T. Funahara, S. Iida, Y. Nakatsu, Y. Kinoshita, H. Saya, and M. Nakao. Simian virus 40 large T antigen targets the microtubule-stabilizing protein TACC2. J. Cell Sci. 122: 3190-3198, 2009.

 

T. Mishiro, K. Ishihara, S. Hino, S. Tsutsumi, H. Aburatani, K. Shirahige, Y. Kinoshita, and M. Nakao. Architectural roles of multiple chromatin insulators at the human apolipoprotein gene cluster. EMBO J. 28: 1234-1245, 2009.

 

L. Liu, K. Ishihara, T. Ichimura, N. Fujita, S. Hino, S. Tomita, S. Watanabe, N. Saitoh, T. Ito, and M. Nakao. MCAF1/AM is involved in Sp1-mediated maintenance of cancer-associated telomerase activity. J. Biol. Chem. 284: 5165-5174, 2009. 

 

S. Watanabe, Y. Ueda, S. Akaboshi, Y. Hino, Y. Sekita, and M. Nakao. HMGA2 maintains oncogenic RAS-induced epithelial-mesenchymal transition in human pancreatic cancer cells. Am. J. Pathol. 174: 854-868, 2009. 

 

T. Zhao, J. Yasunaga, M. Nakao, M. Fujii, and M. Matsuoka. Human T-cell leukemia virus type 1 bZIP factor selectively suppresses the classical pathway of NF-kB. Blood 113: 2755-2764, 2009. 

 

K. Kuwayama, K. Matsuzaki, Y. Mizobuchi, H. Mure, K. Kitazato, T. Kageji, M. Nakao, S. Nagahiro. Promyelocytic leukemia protein induces apoptosis due to caspase-8 activation via the repression of NF-kB activation in glioblastoma. Neuro-Oncol. 11: 132-141, 2009. 

 

T. Aoto, N. Saitoh, Y. Sakamoto, S. Watanabe, and M. Nakao. Polycomb group protein-associated chromatin is reproduced in post-mitotic G1 phase and required for S phase progression. J. Biol. Chem. 283: 18905-18915, 2008. 

 

K.S. Wendt, K. Yoshida, T. Itoh, M. Bando, B. Koch, E. Schirghuber, S.Tsutsumi, G. Nagae, K. Ishihara, T. Mishiro, K. Yahata, F. Imamoto, H.Aburatani, M. Nakao, N. Imamoto, K. Maeshima, K. Shirahige, and J.M. Peters. Cohesin mediates transcriptional insulation by CCCTC-binding factor. Nature 451: 796-803, 2008.

 

Y. Ueda, S. Watanabe, S. Tei, N. Saitoh, J. Kuratsu, and M. Nakao. The high mobility group protein HMGA1 inhibits retinoblastoma protein-mediated cellular G0 arrest. Cancer Sci. 98: 1893-1901, 2007.

 

Y. Sakamoto, S. Watanabe, T. Ichimura, M. Kawasuji, H. Koseki, H. Baba, and M. Nakao. Overlapping roles of the methylated DNA binding protein MBD1 and polycomb group proteins in transcriptional repression of HoxA genes and heterochromatin foci formation. J. Biol. Chem. 282: 16391-16400, 2007. 

 

S. Kobayakawa, K. Miike, M. Nakao, and K. Abe. Dynamic changes in the epigenomic state and nuclear organization of differentiating mouse embryonic stem cells. Genes Cells 12: 447-460, 2007.

 

S. Tsuruzoe, K. Ishihara, Yasuhiro Uchimura, S. Watanabe, Y. Sekita, T. Aoto, H. Saitoh, Y. Yuasa, H. Niwa, M. Kawasuji, H. Baba, and M. Nakao. Inhibition of DNA binding of Sox2 by the SUMO conjugation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 351: 920-926, 2006. 

 

T. Aoto, N. Saitoh, T. Ichimura, H. Niwa, and M. Nakao. Nuclear and chromatin reorganization in the MHC-Oct3/4 locus at developmental phases of embryonic stem cell differentiation. Dev. Biol. 298: 345-367, 2006. 

 

K. Ishihara, M. Oshimura, and M. Nakao. CTCF-dependent chromatin insulator is linked to epigenetic remodeling. Mol. Cell 23: 733-742, 2006. 

 

MA. Suico, H. Nakamura, Z. Lu, H. Saitoh, T. Shuto, M. Nakao, and H. Kai. SUMO down-regulates the activity of Elf4/Myeloid Elf-1-like factor. Biochem. Biophys.Res. Commun. 348: 880-888, 2006. 

 

Y. Uchimura, T. Ichimura, J. Uwada, T. Tachibana, S. Sugahara, M. Nakao, and H. Saitoh. Involvement of SUMO modification in MBD1- and MCAF1- mediated heterochromatin formation. J. Biol. Chem.281: 23180-23190, 2006. 

 

N. Saitoh, Y. Uchimura, T. Tachibana, S. Sugahara, H. Saitoh, and M. Nakao. In situ SUMOylation analysis reveals a modulatory role of RanBP2 in the nuclear rim and PML bodies. Exp. Cell Res. 312: 1418-1430, 2006. 

 

K. Ikeda, K. Iyama, N. Ishikawa, H. Egami, M. Nakao, Y. Sado, Y. Ninomiya, and H. Baba. Loss of expression of type IV collagen a5 and a6 chains in colorectal cancer associated with the hypermethylation of their promoter region. Am. J. Pathol. 168: 856-865, 2006.

 

L-K. Chang, J-Y. Chuang, Y-R. Hong, T. Ichimura, M. Nakao, and S-T. Liu. Activation of Sp1-mediated transcription by Rta of Epstein-Barr virus via an interaction with MCAF1. Nucleic Acids Res. 33: 6528-6539, 2005.

 

Y. Arima, M. Nitta, S. Kuninaka, D. Zhang, T. Fujiwara, Y. Taya, M. Nakao, and H. Saya. Transcriptional blockade induces p53-dependent apoptosis associated with translocation of p53 to mitochondria. J. Biol. Chem. 280: 9166-19176, 2005. 

 

T. Kamikihara, T. Arima, K. Kato, T. Matsuda, H. Kato, T. Douchi, Y. Nagata, M. Nakao, and N. Wake. Epigenetic silencing of the imprinted gene ZAC by DNA methylation is an early event in the progression of human ovarian cancer. Int. J. Cancer 115: 690-700, 2005.

 

J. Fan, E. Kodama, Y. Koh, M. Nakao, and M. Matsuoka. Haloganated thymidine analogs restore the expression of silenced genes without demethylation. Cancer Res. 65: 6927 -6933, 2005. 

 

T. Ichimura, S. Watanabe, Y. Sakamoto, T. Aoto, N. Fujita, and M. Nakao.
Transcriptional repression and heterochromatin formation by MBD1 and MCAF/AM family proteins. J. Biol. Chem. 280: 13928-13935, 2005. 

 

Y. Uchimura, M. Nakamura, K. Sugasawa, M. Nakao, and H. Saitoh. Overproduction of eukaryotic SUMO-1- and SUMO-2-conjugated proteins in Escherichia coli. Anal. Biochem. 331: 204-206, 2004. 

 

Y. Uchimura, M. Nakao, and H. Saitoh. Generation of SUMO-1 modified proteins in E. coli: towards understanding the biochemistry/structural biology of the SUMO-1 pathway. FEBS Lett. 564: 85-90, 2004. 

 

M. Nakao, T. Minami, Y. Ueda, Y. Sakamoto, and T. Ichimura. Epigenetic system: a pathway to malignancies and a therapeutic target. Int. J. Hematol. 80: 103-107, 2004. 

 

M. A. Suico, Z. Lu, T. Shuto, T. Koga, T. Uchikawa, H. Yoshida, K. Matsuzaki, M. Nakao, J-D. Li, and H. Kai. The regulation of human β-Defensin 2 by the ETS transcription factor MEF is enhanced by PML protein. J. Pharmacol. Sci. 95: 466-470, 2004. 

 

M. A. Suico, H. Yoshida, Y. Seki, T. Uchikawa, Z. Lu, T. Shuto, K. Matsuzaki, M. Nakao, J-D. Li, and H. Kai. The ETS transcription factor MEF up-regulates lysozyme transcription in epithelial cells through interaction with PML protein. J. Biol. Chem. 279: 19091-19098, 2004.

 

S. Watanabe, T. Ichimura, N. Fujita, S. Tsuruzoe, I. Ohki, M. Shirakawa, M. Kawasuji. and M. Nakao. Methylated DNA-binding domain 1 and methylpurine-DNA glycosylase links transcriptional repression and DNA repair in chromatin. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100: 12859-12864, 2003. 

 

N. Fujita, S. Watanabe, T. Ichimura, Y. Ohkuma, T. Chiba, H. Saya, and M. Nakao. MCAF mediates MBD1-dependent transcriptional repression. Mol. Cell. Biol. 23: 2834-2843, 2003. 

 

N. Fujita, S. Watanabe, T. Ichimura, S. Tsuruzoe, Y. Shinkai, M. Tachibana, T. Chiba, and M. Nakao. Methyl-CpG binding domain 1 (MBD1) interacts with Suv39h1-HP1 heterochromatic complex for DNA methylation-based transcriptional repression. J. Biol. Chem. 278: 24132-24138, 2003. 

 

K. Matsuzaki, T. Minami, M. Tojo, Y. Honda, Y. Uchimura, H. Saitoh, H. Yasuda, S. Nagahiro, H. Saya, and M. Nakao. Serum response factor is modulated by the SUMO-1 conjugation system. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306: 32-38, 2003. 

 

K. Matsuzaki, T. Minami, M. Tojo, Y. Honda, N. Saitoh, S. Nagahiro, H. Saya, and M. Nakao. PML-nuclear bodies are involved in cellular serum response. Genes Cells 8: 275-286, 2003. 

 

J. Yasuda, M. Nakao, Y. Kawaoka, and H. Shida. Nedd4 regulates Egress of Ebola virus-like particles from host cells. J. Virol. 77: 9987-9992, 2003. 

 

S. Kudo, Y.†Nomura, M. Segawa,††N. Fujita, M. Nakao, C. Schanen, and M. Tamura. Heterogeneity in residual function of MeCP2 carrying missense mutations in the methyl-CpG-binding domain. J. Med. Genet. 40: 487-493, 2003. 

 

M. Tojo, K. Matsuzaki, T. Minami, Y. Honda, H. Yasuda, T. Chiba, H. Saya, Y. Fujii-Kuriyama, and M. Nakao. The aryl hydrocarbon receptor nuclear transporter is modulated by the SUMO-1 conjugating system. J. Biol. Chem. 277: 46576-46585, 2002. 

 

Y. Honda, M. Tojo, K. Matsuzaki, T. Anan, M. Matsumoto, M. Ando, H. Saya, and M. Nakao. Cooperation of HECT-domain ubiquitin ligase hHYD and DNA topoisomerase II-binding protein for DNA damage response. J. Biol. Chem. 277: 3599-3605, 2002. 

 

J. Yasuda, E. Hunter, M. Nakao, and H. Shida. Functional involvement of a novel Nedd4-like ubiquitin ligase on retrovirus budding. EMBO Reports 3: 636-640, 2002. 

 

K. Kagotani, H. Nabeshima, A. Kohda, M. Nakao, H. Taguchi, and K. Okumura. Visualization of transcription-dependent association of imprinted genes with the nuclear matrix. Exp. Cell Res. 274: 189-196, 2002. 

 

S. Kudo, Y. Nomura, M. Segawa, M. Nakao, C. Schanen, M. Tamura. Functional characterization of MeCP2 mutations found in male patients with X-linked mental retardation. J. Med. Genet. 39: 132-136, 2002. 

 

M. Nakao. Epigenetics: interactions of DNA methylation and chromatin. Gene 278: 25-31, 2001. 

 

M. Nakao, S. Matsui, S. Yamamoto, K. Okumura, M. Shirakawa, and N. Fujita. Regulation of transcription and chromatin by methyl-CpG binding protein MBD1. Brain Dev. 23 Suppl 1: S174-176, 2001. 

 

S. Kudo, Y. Nomura, M. Segawa, N. Fujita, M. Nakao, J. Dragich, C. Schanen, M. Tamura. Functional analyses of MeCP2 mutations associated with Rett syndrome using transient expression systems.Brain Dev. 23 Suppl 1: S165-173, 2001. 

 

T. Sudo, Y. Ota, M. Nakao, Y. Takami, S. Takeda, and H. Saya. Activation of Cdh1-dependent APC is required for G1 cell cycle arrest and DNA damage-induced G2 checkpoint in vertebrate cells. EMBO J. 20: 6499-6508, 2001. 

 

T. Takizawa, K. Nakashima, M. Namihira, W. Ochiai, A. Uemura, M. Yanagisawa, N. Fujita, M. Nakao, and T. Taga. DNA methylation is a critical cell-intrinsic determinant of astrocyte differentiation in the fetal brain. Dev. Cell 1: 749-758, 2001. 

 

I. Ohki, N. Shimotake, N. Fujita, J-G. Jee, T. Ikegami, M. Nakao, and M. Shirakawa. Solution structure of the methyl-CpG-binding domain of human MBD1 in complex with a methylated DNA. Cell 105: 487-497, 2001. 

 

M. A. EL-Gazzar, K. Maeda, K. Kuwahara, H. Nomiyama, M. Nakao, and N. Sakaguchi. PU.1 is involved in the regulation of B lineage-associated and developmental stage-dependent expression of the germinal center-associated DNA-primase GANP. J. Biol. Chem. 276: 48000-48008, 2001. 

 

T. Kino, H. Takeshima, M. Nakao, T. Nishi, K. Yamamoto, T. Kimura, Y. Saito, M. Kochi, J. Kuratsu, H. Saya, Y. Ushio. Identification of the cis-acting region in the NF2 gene promoter as a potential target for mutation and methylation-dependent silencing in schwannoma. Genes Cells 6: 441-454, 2001. 

 

S. Takebayashi, M. Nakao, N. Fujita, T. Sado, M. Tanaka, H. Taguchi, and K. Okumura.　5-aza-2’-deoxycytidine induces histone hyperacetylation of mouse centromeric heterochromatin by a mechanism independent of DNA demethylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 288: 921-926, 2001. 

 

T. Kaneko, T. Yamashima, Y. Tohma, M. Nomura, S. Imajoh-Ohmi, T.C. Saido, M.Nakao, H. Saya, and J. Yamashita. Calpain-dependent proteolysis of merlin occurs by oxidative stress in meningiomas.Cancer 92: 2662-2672, 2001. 

 

M. Meguro, A. Kashiwagi, K. Mitsuya, M. Nakao, I. Kondo, S. Saitoh, and M. Oshimura. A novel maternally expressed gene, ATP10C, encodes a putative aminophospholipid translocase associated with Angelman syndrome. Nature Genet. 28: 19-20, 2001. 

 

M. Meguro, K. Mitsuya, N. Nomura, M. Kohda, A. Kashiwagi, R. Nishigaki, H. Yoshioka, M. Nakao, M. Oishi, and M. Oshimura. Large-scale evaluation of imprinting status in the Prader-Willi syndrome region: an imprinted direct repeat cluster resembling small nucleolar RNA genes. Hum. Mol. Genet.10: 383-394, 2001. 

 

N. Fujita, N. Shimotake, I. Ohki, T. Chiba, H. Saya, M. Shirakawa, and M. Nakao. Mechanism of transcriptional regulation by methyl-CpG binding protein MBD1. Mol. Cell. Biol. 20: 5107-5118, 2000. 

 

M. Nogami, A. Kohda, H. Taguchi, M. Nakao, T. Ikemura, and K. Okumura. Relative locations of the centromere and imprinted SNRPN gene within chromosome 15 territories during the cell cycle in HL60 cells. J. Cell Sci. 113: 2157-2165, 2000. 

 

Y. Kimura, H. Saya, and M. Nakao. Calpain-dependent proteolysis of NF2 protein: The involvement in schwannomas and meningiomas. Neuropathol. 20: 153-160, 2000. 

 

N. Mugita, Y. Honda, H. Nakamura, T. Fujiwara, K. Tanaka, S. Omura, N. Shimbara, M. Ogawa, H. Saya, and M. Nakao. The involvement of proteasome in myogenic differentiation of murine myocytes and human rhabdomyosarcoma cells. Int. J. Mol. Med. 3: 127-137, 1999. 

 

I. Okamoto, Y. Kawano, H. Tsuiki, J. Sasaki, M. Nakao, M. Matsumoto, M. Suga, M. Ando, M. Nakajima, and H. Saya. CD44 cleavage induced by a membrane-associated metalloprotease plays a critical role in tumor cell migration. Oncogene 18: 1435-1446, 1999. 

 

K. Yamamoto, H. Takeshima, K. Hamada, M. Nakao, T. Kino, T. Nishi, M. Kochi, J. Kuratsu, T. Yoshimura, and Y. Ushio. Cloning and functional characterization of the 5′-flanking region of the human monocyte chemoattractant protein-1 receptor (CCR2) gene. J. Biol. Chem. 274: 4646-4654, 1999. 

 

Y. Nagata, T. Anan, T. Yoshida, T. Mizukami, Y. Taya, T. Fujiwara, H. Kato, H. Saya, and M. Nakao. The stabilization mechanism of mutant-type p53 by impaired ubiquitination: the loss of wild-type p53 function and the hsp90 association. Oncogene 18: 6037-6049, 1999. 

 

M. Nakao, Y. Kimura, and H. Saya. Emerging Therapeutic Targets in Meningiomas and Schwannomas: The Neurofibromatosis type 2 protein (Merlin). Emerging Therapeutic Targets (Ashley Publications Ltd.) 3: 335-364, 1999. 

 

N. Fujita, S. Takebayashi, K. Okumura, S. Kudo, T. Chiba, H. Saya, and M. Nakao. Methylation-mediated transcriptional silencing in euchromatin by methyl-CpG binding protein MBD1 isoforms. Mol. Cell. Biol. 19: 6415-6426, 1999. 

 

K. Ito, I. Okamoto, N. Araki, Y. Kawano, M. Nakao, S. Fujiyama, K. Tomita, T. Mimori, and H. Saya. Calcium influx triggers the sequential proteolysis of extracellular and cytoplasmic domains of E-cadherin, leading to loss of b-catenin from cell-cell contacts. Oncogene 18: 7080-7090, 1999. 

 

I. Ohki, N. Shimotake, N. Fujita, M. Nakao, and M. Shirakawa. Solution structure of the methyl-CpG binding domain of the methylation-dependent transcriptional repressor MBD1. EMBO J. 18: 6653-6661, 1999. 

 

H. Nakamura, M. Yoshida, H. Tsuiki, K. Ito, M. Ueno, M. Nakao, K. Oka, M. Tada, M. Kochi, J. Kuratsu, Y. Ushio, and H. Saya. Identification of a human homolog of the Drosophila neuralized gene within the 10q25.1 malignant astrocytoma deletion region. Oncogene 16: 1009-1019, 1998. 

 

Y. Kimura, H. Koga, N. Araki, N. Mugita, N. Fujita, H. Takeshima, T. Nishi, T. Yamashima, T.C. Saido, T. Yamasaki, K. Moritake, H. Saya, and M. Nakao. The involvement of calpain-dependent proteolysis of the tumor suppressor NF2 (merlin) in schwannomas and meningiomas. Nature Med. 4: 915-922, 1998. 

 

H. Koga, N. Araki, H. Takeshima, T. Nishi, T. Hirota, Y. Kimura, M. Nakao, and H. Saya. Impairment of cell adhesion by expression of the mutant neurofibromatosis type 2 (NF2) genes which miss exons in the ERM-homology domain. Oncogene 17: 801-810, 1998. 

 

T. Anan, Y. Nagata, H. Koga, Y. Honda, N. Yabuki, C. Miyamoto, A. Kuwano, I. Matsuda, F. Endo, H. Saya, and M. Nakao. Human ubiquitin-protein ligase Nedd4: expression, subcellular localization, and selective interaction with ubiquitin-conjugating enzymes. Genes Cells 3 : 751-763, 1998.

 

 

和文著書（単行本）

中尾光善．体質は3年で変わる．集英社新書、2023. (205頁)

 

中尾光善．環境とエピゲノム―からだは環境によって変わるのか？―．丸善出版、2018. （192頁）

 

中尾光善．体質と遺伝子のサイエンス－あなたと私はどうして違う？　99.9％同じ設計図から個性と病気が生じる秘密．羊土社、2015. (221頁)

 

中尾光善．驚異のエピジェネティクス－遺伝子がすべてではない!?　生命のプログラムの秘密．羊土社、2014. (214頁)

 

和文総説（現在～2001年）

衛藤貫、中尾光善．遺伝子発現変動を自動的に解析するウェブツール「RNAseqChef」、実験医学（印刷中）.

 

中尾光善．代謝とエピゲノムによる細胞老化の制御機構、生体の科学（増大号）（印刷中）.

 

日野裕子、日野信次朗、中尾光善．ミトコンドリアから細胞核への逆行性シグナルによるエンハンサーリモデリング、医学の歩み（印刷中）.

 

中尾光善．生活習慣病胎児期起源説：脂肪組織と骨格筋における２つの代謝エピゲノム経路、食と医療、24: 21-29, 2023.

 

古賀友紹、中尾光善．トランスクリプトーム・エピゲノムの統合解析、遺伝子解析 新技術とその応用、和光純薬時報、89: 10-11, 2021.

 

日野信次朗、荒木裕貴、中尾光善．環境応答性エピゲノム形成と肥満の個人差、実験医学増刊（個人差の理解へ向かう肥満症研究）、5: 139-144, 2021.

 

荒木裕貴、日野信次朗、中尾光善．エピゲノムを介した栄養センシングと代謝恒常性の維持・調節、糖尿病・内分泌代謝科、51: 315-322, 2020.

 

阿南浩太郎、中尾光善．小児遺伝性疾患とエピジェネティクス、遺伝子医学MOOK別冊（最新遺伝医学研究と遺伝カウンセリング）、メディカル・ドゥ、48-53, 2019.

 

中尾光善． Developmental Origins of Health and Disease (DOHaD)とエピジェネティクス、早産児,低出生体重児の成長と発達のみかた－出生からAYA世代まで－、東京医学社、198-208, 2019.

 

阿南浩太郎、日野信次朗、中尾光善．ヒストン脱メチル化酵素LSD1による骨格筋細胞の代謝リプログラミング、生化学、91: 31-37, 2019.

 

中尾光善．あなたと私はどうして違う？ 体質と遺伝子のサイエンス、日本臨床栄養協会誌、34: 19-23, 2018.

 

藤原沙織、中尾光善．乳癌のエピゲノム異常と診断・治療への応用、がん不均一性を理解し、治療抵抗性に挑む、実験医学別冊、羊土社、36: 148-153/全199頁, 2018.

 

中尾光善．総論「DOHaD学説を科学する」、エピジェネティクスと臨床―DOHaD学説のインパクト（中尾光善 編纂）、Medical Science Digest、ニューサイエンス、43: 601-603, 2017.

 

長岡克弥、坂元顕久、日野信次朗、中尾光善.　リジン脱メチル化酵素LSD1/2と糖脂質代謝制御、The Lipid（エピゲノムとメタボリズムのクロストーク）、メディカルレビュー社、28: 228-234, 2017.

 

田中真二、中尾光善、菅波孝祥、嘉数英二．座談会 ニュートリゲノミクスの研究と臨床への展望、肝胆膵（アークメディア）、75: 147-160, 2017.

 

中尾光善．序論、エピジェネティクスと環境科学（中尾光善 企画）、最新醫學（最新医学社）、72: 649-650, 2017.

 

日野信次朗．エネルギー代謝のエピジェネティクス、エピジェネティクスと環境科学（中尾光善 企画）、最新醫學（最新医学社）、72: 672-677, 2017.

 

山本達郎、中尾光善、斉藤典子．クロマチンを制御するノンコーディングRNA、生体の科学（特集核内イベントの時空間制御）、医学書院、68: 215-219, 2017.

 

石原宏、中尾光善．3C・4C法によるクロマチン高次構造解析、エピジェネティクス実験スタンダード、実験医学別冊、羊土社、335-344, 2017.

 

山本達郎、中尾光善、斉藤典子．クロマチンから核構造へ、遺伝子発現制御機構－クロマチン, 転写制御, エピジェネティクス－（田村隆明・浦聖恵 編）、東京化学同人、231-242, 2017.

 

日野信次朗、阿南浩太郎、高瀬隆太、興梠健作、中尾光善．FAD依存性ヒストン脱メチル化酵素による遺伝子制御、実験医学増刊（遺伝子制御の新たな主役　栄養シグナル）、34: 88-94, 2016.

 

興梠健作、日野信次朗、中尾光善.　環境エピゲノムと疾患、Bio Clinica（エピゲノムの遺伝）、31: 23-27, 2016.

 

田中宏、坂元顕久、中尾光善.　エピジェネティック調節（ヒストン修飾）、生体の科学（細胞シグナル操作法）、金原一郎医学医療振興財団/医学書院、66: 476-477, 2015.

 

中元雅史、森山雅文、石原 宏、中尾光善.　グルココルチコイドの作用とドライシンドローム、ドライシンドロームの基礎と臨床（坪田一男、斎藤一郎 監修）、メディカルレビュー社 99-105, 2016

 

日野信次朗、中尾光善.　エネルギー代謝とエピジェネティクス、The Lipid、メディカルレビュー社、26: 181-184, 2015.

 

斉藤典子、坂本智代美、松森はるか、中尾光善、Ilya G. Goldberg.　機械学習による細胞形態の分類と推定、バイオ画像解析 手とり足とりガイド（小林徹也・青木一洋 編）、羊土社、195-207, 2014.

 

安田洋子、斉藤典子、藤原沙織、Mohamed O. Abdalla、松森はるか、坂本智代美、中尾光善.　クロマチン構造と核異型．病理と臨床、文光堂、32: 789-795, 2014.

 

高瀬隆太、日野信次朗、中尾光善.　エネルギー代謝のエピジェネティック制御と疾患、エピジェネティクスの産業応用、シーエムシー出版、189-197, 2014.

 

斉藤典子、松森はるか、Mohamed O. Abdalla、藤原沙織、安田洋子、中尾光善.　核内高次構造、エピジェネティクスキーワード事典、羊土社、91-98, 2013.

 

石原宏、中元雅史、中尾光善.　高次構造解析、エピジェネティクスキーワード事典、羊土社、282-289, 2013.

 

斉藤典子、徳永和明、松森はるか、中尾光善.　核内ボディーの構造・機能・形成機序、染色体と細胞核のダイナミクス（平岡泰・原口徳子 編）、化学同人、147-168, 2013.

 

竹林慎一郎、中尾光善. 哺乳類遺伝子発現に重要な高次エピゲノム制御、化学と生物、51: 597-599, 2013.

 

阿南浩太郎、中尾光善、日野信次朗.　エネルギー代謝病、遺伝子医学MOOK25号（エピジェネティクスと病気）（佐々木裕之、中尾光善、中島欽一 編）、メディカル・ドゥ、106-111, 2013.

 

藤原沙織、冨田さおり、中尾光善.　乳癌のエピゲノム異常と診断・治療への応用、遺伝子医学MOOK25号（エピジェネティクスと病気）（佐々木裕之、中尾光善、中島欽一 編）、メディカル・ドゥ、88-94, 2013.

 

冨田さおり、笹井信広、日野信次朗、中尾光善.　エピゲノム修飾を標的とした癌治療ポテンシャル、日本臨床、70: 91-97, 2012.

 

中尾光善.　基礎の基礎、3D-エピゲノムが生む新たな生命情報（中尾光善 監修）、細胞工学、31: 858-862, 2012.

 

斉藤典子、徳永和明、松森はるか、冨田さおり、中尾光善.　細胞核内構造の計測・分類、3D-エピゲノムが生む新たな生命情報（中尾光善 監修）、細胞工学、31: 870-876, 2012.

 

日野信次朗、中尾光善.　エピジェネティック制御、シグナル伝達キーワード事典（山本雅、仙波憲太郎、山梨裕司 編集）、羊土社、327-334, 2012

 

中尾光善、日野信次朗.　エピジェネティクス機構による代謝制御と病態、栄養とエピジェネティクス―食による身体変化と生活習慣病の分子機構―（ネスレ栄養科学会議監修）、建帛社、63-73, 2012.

 

木下　聡、渡邊智佳子、中尾光善.　遺伝子調節とヒト疾患（12章翻訳）、遺伝情報の発現制御―転写機構からエピジェネティクスまで（David S. Latchman 原著、五十嵐和彦、深水昭吉、山本雅之 監訳）、メディカル・サイエンス・インターナショナル、2012

 

中尾光善.　概論―エピジェネティック遺伝：生命情報のメモリーに迫る、代謝エピジェネティクス（中尾光善 編）、実験医学、29: 2204-2210, 2011.

 

坂元顕久、長岡克弥、阿南浩太郎、中尾光善、日野信次朗.　癌代謝とエピジェネティクス、代謝エピジェネティクス（中尾光善 編）、実験医学、29: 2231-2235, 2011.

 

中尾光善.　エピジェネティクス機構による細胞制御と病態、日本体質医学会雑誌、73: 47-49, 2011.

 

城圭一郎、副島英伸、中尾光善.　エピジェネティクスとヒト疾患（23章翻訳）、エピジェネティクス（C. David Allis, Thomas Jenuwein, Danny Reinberg編、堀越正美 監訳）、培風館、269-290, 2010.

 

笹井信広、中尾光善.　DNAメチル化を介した転写制御機構、エピジェネティクスと疾患（牛島俊和、塩田邦郞、田嶋正二、吉田稔 編）、実験医学、28: 53-59, 2010.

 

小椋光、中尾光善、粂昭苑、西中村隆一 .「発生医学の共同研究拠点」の船出、再生医療、8: 17-22, 2009.

 

斉藤典子、徳永和明、冨田さおり、中尾光善. 核異型の背景にあるエピジェネティクス、病理と臨床、27: 653-658, 2009.

 

徳永和明、斉藤典子、習陽、中尾光善.　組織幹細胞のエピジェネティック制御機構、最新医学、64: 1286-1297, 2009.

 

中尾光善.　基礎の基礎、疾患エピジェネティクスの新展開（中尾光善 編）、細胞工学、28: 522-527, 2009.

 

日野信次朗、坂元顕久、中尾光善.　エネルギー代謝病のエピジェネティクス、疾患エピジェネティクスの新展開（中尾光善編）、細胞工学、28: 535-540, 2009.

 

中尾光善.　エピジェネティクス、分子生物学イラストレイテッド改訂第3版（田村隆明、山本雅編：羊土社）、105-111, 2008（分担）

 

三代　剛、廣末晃之、渡邊丈久、石原　宏、中尾光善 . 　高脂血症・脂肪肝とエピジェネティクス、分子消化器病、 5: 351-357, 2008.

 

日野信次朗、中尾光善 . DNA メチル化と転写制御機構、転写制御とエピジェネティクス（加藤茂明 編）、 91-98, 2008.

 

石原宏、斉藤典子、船原徹士、中尾光善 . 　エピジェネティクスの制御システム、臨床検査（エピジェネティクスと臨床検査） 52: 613-621, 2008.

 

中尾光善 . 　エピジェネティクスと疾患、小児内科増刊号（小児疾患診療のための病態生理１、第 4 版）、 30-35, 2008.

 

宇和田淳介、斉藤典子、中尾光善、斉藤寿仁 . SUMO 修飾による核構造モジュレーションと細胞のがん化、生体の科学、 59: 352-353, 2008.

 

渡邉すぎ子、赤星慎一、渡邊丈久、中尾光善 . miRNA とエピジェネティクス、実験医学（増刊号）、 26: 104-110, 2008.

 

日野信次朗、渡邉すぎ子、中尾光善.　DNAメチル化を介したエピジェネティック制御機構、実験医学増刊号、25: 118-123, 2007.

 

丁　秀鎮、坂本快郎、赤星慎一、三代　剛、渡邉すぎ子、斉藤典子、中尾光善.　 老化および発癌のエピジェネティクス、日本高齢消化器病学会誌、8: 28-37, 2007.

 

市村隆也、中尾光善、伊藤隆明.　老化のエピジェネティクス、The Lung、15: 72-75, 2007.

 

渡邉すぎ子、上田泰明、坂本快郎、赤星慎一、中尾光善.　がんとエピジェネティクス・遺伝子サイレンシングの分子機構、Surgery Frontier 13: 401-404, 2006.

 

青戸隆博、中尾光善.　エピジェネティクスと核リプログラミング、蛋白質核酸酵素増刊号（細胞核の世界、米田悦啓、木村　宏、五十嵐和彦、中尾光善 編）、51: 2024-2026, 2006.

 

斉藤典子、青戸隆博、丁　秀鎮、仁木エミ、中津有子、中尾光善.　核内構造体・クロマチン間領域、蛋白質核酸酵素増刊号（細胞核の世界、米田悦啓、木村　宏、五十嵐和彦、中尾光善 編）、51: 1957-1963, 2006.

 

中尾光善.　生命の原点に挑むエピジェネティクス医科学、実験医学増刊号（エピジェネティクス医科学、中尾光善、塩田邦郎、牛島俊和、佐々木裕之編）、24: 1038-1044, 2006.

 

斉藤典子、青戸隆博、丁　秀鎮、中津有子、中尾光善.　細胞核構造とその機能、実験医学増刊号（エピジェネティクス医科学、中尾光善、塩田邦郎、牛島俊和、佐々木裕之 編）、24: 1139-1145, 2006.

 

石原　宏、中尾光善.　クロマチンインスレーターの構造と機能、実験医学増刊号（エピジェネティクス医科学、中尾光善、塩田邦郎、牛島俊和、佐々木裕之編）、24: 1083-1089, 2006.

 

渡邉すぎ子、上田泰明、坂本快郎、赤星慎一、中尾光善.　構造的クロマチン因子 -遺伝子発現とゲノム安定性の調節-、実験医学増刊号（エピジェネティクス医科学、中尾光善、塩田邦郎、牛島俊和、佐々木裕之 編）、24: 1052-1060, 2006.

 

斉藤典子、青戸隆博、丁　秀鎮、中尾光善.　細胞核・クロマチンのダイナミクス、蛋白質核酸酵素51: 302-309, 2006.

 

三代　剛、斉藤典子、内村康寛、宇和田淳介、中尾光善、斉藤寿仁.　PMLとNPMの機能制御と白血病の分子病態.　血液・腫瘍科、51: 577-585, 2005.

 

青戸隆博、市村隆也、坂本快郎、南　建、中尾光善.　個体発生におけるメチル化DNA結合タンパク質の役割.　実験医学、23: 2107-2114, 2005.

 

坂本快郎、市村隆也、水流添周、中尾光善.　加齢とDNAメチル化異常.　日本老年医学会雑誌、42: 137-143, 2005.

 

斉藤典子、青戸隆博、中尾光善.　核内構造と動態.　細胞核の分子生物学－クロマチン・染色体・核構造-（水野重樹 編）132-154, 2005.

 

斉藤典子、上田泰明、中尾光善.　細胞核プロテオミクス解析　遺伝子医学（疾患プロテオミクスの最前線、戸田年総、荒木令江 編）、284-289, 2005.

 

市村隆也、坂本快郎、渡邉すぎ子、中尾光善.　DNAメチル化とクロマチン修飾の両方向性の経路.　細胞工学、23: 1144-1149, 2004.

 

中尾光善、上田泰明、青戸隆博.　構造的クロマチン因子による遺伝子発現の調節、エピジェネティクスがわかる（押村光雄 編）、わかる実験医学シリーズ、30-36, 2004.

 

石原　宏、佐々木裕之、中尾光善.　クロマチンインスレーターの構造と機能、エピジェネティクスがわかる（押村光雄 編）、わかる実験医学シリーズ、63-68, 2004.

 

渡邉すぎ子、市村隆也、坂本快郎、中尾光善.　メチル化DNA結合タンパク質の解析、クロマチン・染色体実験プロトコール（押村光雄、平岡泰 編）実験医学別冊、78-83, 2004.

 

安田二朗、中尾光善.　Nedd4ユビキチンリガーゼファミリーとウイルス出芽機構.　現代医療、36: 69-74, 2004.

 

斉藤典子、青戸隆博、中尾光善.　細胞核ドメインとエピジェネティクス、細胞核のダイナミクス（竹安邦夫、米田悦啓 編：シュプリンガー・フェアラーク東京）、109-119, 2004.

 

坂本快郎、市村隆也、渡邉すぎ子、中尾光善.　メチル化DNA結合タンパク質による転写抑制機構、エピジェネティクス（佐々木裕之 編：シュプリンガー・フェアラーク東京）、21-29, 2004.

 

水流添周、坂本快郎、市村隆也、中尾光善.　癌とエピジェネティクス、最新医学、58: 18-29, 2003.

 

工藤伸一、中尾光善.　エピジェネティクスと発生異常、分子細胞治療、2: 26-32, 2003.

 

中尾光善、市村隆也、水流添周、渡邉すぎ子.　メチル化DNA結合タンパク質を基盤にしたエピジェネティクス、実験医学、21: 1448-1454, 2003.

 

市村隆也、水流添周、坂本快郎、上田泰明、渡邉すぎ子、中尾光善.　エピジェネティクスを分子標的とする制癌剤と科学技術の開発、分子細胞治療、2: 351-358, 2003.

 

石原　宏、中尾光善.　クロマチン動態と遺伝子発現の調節プログラム、再生医学（須田年生、岡野栄之編集）、Molecular Medicine　40: 34-41, 2003.

 

渡邉すぎ子、市村隆也、水流添周、中尾光善.　メチル化DNA結合タンパク質の転写抑制とDNA修復における役割、現代医療、35: 949-956, 2003.

 

中尾光善.　モデル生物の特徴と選択、遺伝子医学の基礎知識（本庶　佑監修：メディカルドウ）、142-146, 2003（分担）.

 

中尾光善.　細胞核と機能ドメイン（特集「細胞核 再発見：解明が進む機能ドメインとその役割」の監修）、細胞工学、21: 1138-1142, 2002.

 

斉藤典子、中尾光善、Spector, David.　核スペックル：転写とRNAスプライシングを結ぶ核ドメイン、細胞工学、21: 1169-1173, 2002.

 

安田二朗、Eric Hunter、中尾光善、志田壽利.　ユビキチンリガーゼNedd4様タンパク質によるレトロウイルスの出芽制御、細胞工学、21: 1222-1223, 2002.

 

中尾光善.　エピジェネティクス、分子生物学イラストレイテッド（田村隆明、山本雅編：羊土社）、115-120, 2002（分担）.

 

中尾光善.　個体差に基づくこれからの医科学、バイオサイエンスとインダストリー、60: 476-477, 2002.

 

藤田直之、渡邉すぎ子、市村隆也、中尾光善.　DNAメチル化とMBDタンパク質群による転写制御、Molecular Medicine、39: 757-765, 2002.

 

市村隆也、渡邉すぎ子、藤田直之、中尾光善.　DNAメチル化とクロマチン制御、分子細胞治療、1: 335-338, 2002.

 

南　建、松崎和仁、東條正英、本多慶臣、中尾光善.　DNA損傷シグナリングにおけるユビキチンシステムの役割、細胞工学、21: 601-607, 2002.

 

中尾光善、渡邉すぎ子、市村隆也、水流添周.　DNAメチル化と老化・発がん、老年消化器病雑誌、14: 231-236, 2002.

 

中尾光善.　分子細胞生物学の基礎、脳神経外科医に必要な分子細胞生物学（生塩之敬、山浦晶、佐谷秀行編：三輪書店）、2-15, 2001（分担）.

 

國徳尚子、篠山隆司、中尾光善、新田雅之、松崎和仁、丸本朋稔、湯之上俊二、佐谷秀行.　分子生物学実験手法の基礎、脳神経外科医に必要な分子細胞生物学（生塩之敬、山浦晶、佐谷秀行編：三輪書店）、69-84, 2001（分担）.

 

渡邉すぎ子、藤田直之、市村隆也、中尾光善.　DNAメチル化とエピジェネティクス、G. I. Research、9: 283-290, 2001.

 

東條正英、松崎和仁、南　建、中尾光善.　ユビキチン・プロテアソームと癌、G. I. Research、9: 305-317, 2001.

 

中尾光善.　ゲノム情報を活用する高次の生物システム（特集「エピジェネティクス：DNAメチル化とクロマチンの相互作用」の監修）、細胞工学、20: 342-349, 2001.

 

藤田直之、松井真一、山本すぎ子、中尾光善.　メチル化CpG結合タンパク質の生理機能と疾患との関与、細胞工学、20: 387-392, 2001.

 

松井真一、山本すぎ子、藤田直之、中尾光善.　メチル化CpG結合タンパク質による不活性クロマチンの形成、遺伝子医学 5: 111-113, 2001.

 

[斉藤寿仁] 斉藤寿仁、内村康寛、中村秀明、三浦さき子、土山幸美.　SUMOコードの謎を解く、実験医学（印刷中）

 

内村康寛、斉藤寿仁.　ユビキチンファミリーの制御機構、医学のあゆみ、211: 30-33, 2004.

 

水流添周、内村康寛、斉藤寿仁.　SUMO蛋白質修飾システムのヒト疾患関連性、医学のあゆみ、210: 1076-1077, 2004.

 

斉藤寿仁.　SUMO meets ubiquitin、実験医学、22: 1260-1266, 2004.

 

斉藤寿仁.　SUMO修飾:タンパク質の新しい機能変換システム、細胞工学、22: 996-1002, 2003.

 

斉藤寿仁、内村康寛、藤田英明.　ユビキチンファミリーSUMOとタンパク質輸送、実験医学、21: 45-50, 2003.

 

斉藤寿仁.　SUMO修飾：タンパク質の新しい機能変換システム、細胞工学、22: 996-1002, 2003.

 

斉藤寿仁.　分岐ペプチド結合によるタンパク質の修飾：見えて来たSUMOシステム、化学と生物、40: 618-623, 2002.

 

斉藤寿仁.　SUMO-1付加修飾によるタンパク質の機能変換、遺伝子医学、5: 135-137, 2001.