研究支援・各予約
DNA Sequencing (サンガーシーケンス) 支援
対象

発生医学研究所所属者またはリエゾンラボ研究推進施設のコラボレーショングループに登録された方

 

*2016年4月1日より、コラボレーショングループの方からの依頼は 100円/サンプル の課金をさせていただきます。詳しくはこちらをご覧ください。

 

*当支援に使用するシーケンサー(3130xl Genetic Analyzer)が故障したため、支援の方を中止させていただきます。(2024.4.19)

*Sequencer’s laser power is over. Support will end. (Apr 19, 2024)

 

依頼方法

①DNAサンプルは各自でシークエンス反応→1.5mlマイクロチューブ内にエタノール沈殿→乾燥状態にしたもの。持参の際はアルミホイルなどで遮光してください。

 

②各チューブには1,2,3…と通し番号をマークする。(個人的なサンプル名は受け付けません)

 

③サンプルと一緒にデータ保存用のCD-RまたはRWを持参する。DVD-R, RWも可能です。

 

④CDには所属・氏名・内線番号・メールアドレス・使用したBigDye Terminator v1.1 or  3.1どちらかを明記。

 

⑤解析後はメールにて通知→CDを引き取り。

 

サンプル提出場所

発生医学研究所502 臼杵まで<usu@kumamoto-u.ac.jp>(内線5786)

 

※基本的に事前予約は不要です。
※その日の依頼数や状況により返却が数日遅れることもあります。
※サンプルは返却しません。
※機器の性能として最大600bp前後の解読が可能ですが、サンプルの精製具合に依存します。

※シークエンスデータは以下のフリーソフトで閲覧可能です。

 

↓ABI Sequence Scanner Software など様々な解析ソフトウェアが紹介されています↓

https://www.thermofisher.com/jp/ja/home/life-science/sequencing/sanger-sequencing/sanger-dna-sequencing/sanger-sequencing-data-analysis.html